เซลล์ประสาทที่ทำงานร่วมกันจะผ่านทางไซแนปส์ (synaps) ซึ่งเป็นช่องว่างเล็กๆที่อยู่ระหว่างเซลล์ประสาทกับเซลล์ประสาท และเซลล์ประสาทกับหน่วยปฎิบัติการ (effectors)
เมื่อกระแสประสาทเคลื่อนที่มาที่ปลายแอกซอน ถุงเล็กๆที่บรรจุสารสื่อประสาท (neurotransmitter) จะเคลื่อนที่ไปรวมกับเยื่อหุ้มเซลล์แล้วปล่อยสารสื่อประสาทแพร่กระจายออกมาข้ามไซแนปส์ไปยังปลายเดนไดรต์ของอีกเซลล์หนึ่ง จากนั้นสารสื่อประสาทก็จะไปเร้าให้มีกระแสประสาทเคลื่อนไปยังเซลล์ประสาทตัวต่อไป
สารสื่อประสาทจำพวกอะซิทิลโคลีน (Acetyl choline) เมื่อไซแนปส์แล้วจะสลายตัวไปโดยการทำงานของเอนไซม์โคลีนเอสเทอเรส (cholinesterase) และสารสื่อประสาทเหล่านี้จะไม่พบที่ปลาย ของเดนไดรต์